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2025 升级!CSD 平台晶体结构数据检索功能与 3D 可视化操作指南
? 全新升级!CSD 平台核心功能解析

作为材料科学和化学领域的重要工具,CSD 平台在 2025 年迎来了一次重大升级。这次升级不仅带来了数据格式的优化,还在晶体结构数据检索和 3D 可视化方面实现了突破性的改进。新的 CSD 6.00 版本采用了全新的数据格式,替换了超过 165,000 个条目中的抑制原子,使用户能够更直观地查看和分析无序模型。这种改进让研究人员在处理复杂晶体结构时,能够获得更准确的信息,从而提升研究效率。

在数据检索方面,CSD 平台新增了在线 3D 子结构搜索功能。以前,这个功能只能在桌面软件 ConQuest 中使用,现在用户可以直接在 WebCSD 上进行操作。这意味着用户无需安装额外软件,只需通过浏览器就能快速定位目标晶体结构。此外,WebCSD 还支持上传 .mol 文件进行搜索,大大节省了复杂分子结构的绘制时间。

? 数据检索新体验:从关键词到晶体结构的精准匹配

CSD 平台的检索功能一直是其核心优势之一,2025 年的升级进一步强化了这一点。用户现在可以通过多种维度的组合检索,精准锁定目标 MOFs。例如,在搜索时,可以同时指定化学连接性、晶体方向扩展、堆积显示等条件,快速筛选出符合要求的晶体结构。

对于新手用户,WebCSD 新增的提示功能非常实用。首次使用时,系统会在页面右下角弹出提示,引导用户如何进行搜索和设置约束条件。这些提示不仅包括基本的操作步骤,还提供了一些高级技巧,帮助用户更高效地使用平台。

在高级检索方面,用户可以通过添加 2D 和 3D 约束来提高搜索的准确性。例如,在 2D 约束中,可以指定特定原子的氢原子位置;在 3D 约束中,可以设置角度、质心、平面等参数。这些功能让用户能够更精确地描述目标结构,从而获得更相关的搜索结果。

? 3D 可视化操作全攻略:让晶体结构动起来

CSD 平台的 3D 可视化功能在 2025 年也有了显著提升。Mercury 软件作为核心可视化工具,新增了孔隙分析工具和水合物分析器。用户可以通过这些工具直接计算 MOF 结构的几何孔隙属性,分析吸附性能与通道尺寸的匹配情况。例如,移除客体分子后重新计算 “活化态” 孔隙,能够更真实地反映材料的实际应用性能。

在交互方面,用户可以自由旋转、缩放和拖动 3D 模型,全方位观察晶体结构。点击模型的某个部分,系统会弹出详细的信息窗口,显示原子坐标、键长、键角等参数。对于复杂的结构,还可以通过叠加配体的方式进行对比分析,帮助用户更好地理解分子间的相互作用。

对于需要进行高通量筛选和 AI 模型训练的用户,CSD 的 Python API 提供了全程自动化支持。研究人员可以通过编写脚本,批量处理数据,实现从数据检索到分析的全流程自动化。例如,Rosseinsky 团队通过 CSD 数据训练机器学习模型,仅凭金属与配体即可预测 MOF 孔隙率,准确率超 80%。

? 实用技巧:如何快速上手 CSD 平台

对于初次使用 CSD 平台的用户,以下几个技巧可以帮助快速上手。首先,利用 WebCSD 的搜索提示功能,逐步熟悉基本的搜索操作。其次,在进行 3D 可视化时,尝试使用不同的显示模式,如配位多面体渲染和堆积显示,以更直观地观察晶体结构。此外,定期查看 CSD 平台的官方博客和教程,了解最新的功能更新和使用技巧。

在处理复杂结构时,可以结合 CSD 平台的多个工具进行分析。例如,先用 ConQuest 进行数据检索,然后通过 Mercury 进行可视化和孔隙计算,最后利用 Python API 进行数据批量处理。这种多工具协同的方式能够大大提高研究效率。

对于需要与他人协作的项目,CSD 平台支持多人同时访问和编辑数据。用户可以创建共享项目,设置不同的权限,方便团队成员之间的协作和交流。

? 总结:CSD 平台引领晶体结构研究新方向

2025 年的升级让 CSD 平台在晶体结构数据检索和 3D 可视化方面达到了新的高度。无论是数据格式的优化,还是功能的扩展,都体现了 CSD 平台对用户需求的深刻理解。新的在线 3D 搜索功能和自动化支持,让研究人员能够更高效地处理数据,加速新材料的设计和开发。

对于材料科学和化学领域的研究人员来说,CSD 平台无疑是一个不可或缺的工具。通过充分利用其强大的检索和可视化功能,结合最新的 AI 技术,研究人员能够在晶体结构研究中取得更多突破。无论是基础研究还是工业应用,CSD 平台都将继续发挥重要作用,引领晶体结构研究的新方向。

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AI Insight

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